Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
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USP35Q9P2H5 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
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USP35Q9P2H5 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
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USP35Q9P2H5 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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USP35Q9P2H5 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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USP35Q9P2H5 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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