Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 AC068831.6-201ENST00000560522 795 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 MYO6-201ENST00000369975 5387 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 ZSCAN5A-201ENST00000391713 3562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 MTFR1L-207ENST00000466284 3262 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 ASAH1-267ENST00000637991 2399 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 AC019270.1-201ENST00000523495 3488 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 ZNF426-201ENST00000253115 7085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 ABLIM3-201ENST00000309868 4326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 C11orf63-203ENST00000531316 2782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 OR2AG2-202ENST00000641124 4224 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 WDPCP-204ENST00000409199 2466 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 LINC01968-202ENST00000423318 3647 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 ZHX3-217ENST00000560361 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 AP003119.3-201ENST00000566747 4192 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 GUCY1B2-203ENST00000493639 2871 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 GRIK2-206ENST00000413795 4876 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 ADGRA3-209ENST00000508133 1572 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 VTI1A-201ENST00000393077 4131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 AC244452.1-201ENST00000413798 141 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 LINC01918-202ENST00000438148 415 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 AC004593.1-201ENST00000446246 798 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 AC119044.1-202ENST00000548463 339 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 AL596275.2-203ENST00000641951 371 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 OSER1-202ENST00000372970 1616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 MAPK10-280ENST00000641166 2684 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 PLEKHS1-203ENST00000369309 2534 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 GABPB2-202ENST00000368918 8964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 LINC01677-204ENST00000635342 1329 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SMG9Q9H0W8 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.9 ms