Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 TRIM53CP-201ENST00000531490 1354 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 RPL18AP14-201ENST00000417685 526 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 LINC01728-201ENST00000428529 524 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AC096677.2-201ENST00000430471 598 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 LINC01681-201ENST00000439184 760 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 RN7SL654P-201ENST00000479178 292 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AL035458.2-201ENST00000512005 478 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AC025419.1-203ENST00000540652 726 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 ARGFXP2-201ENST00000579304 949 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AC005479.3-201ENST00000602790 431 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 MBD5-221ENST00000637159 902 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 RNA5SP152-201ENST00000365184 110 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AL079341.1-201ENST00000404701 1207 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
UBXN4Q92575 AL589794.1-201ENST00000424971 390 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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