Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 AC079075.2-201ENST00000557964 449 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PDK4Q16654 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PDK4Q16654 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
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