Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 OR51B4-201ENST00000380224 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 LINC01013-205ENST00000458028 1345 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms