Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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ITGA9Q13797 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
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ITGA9Q13797 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
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ITGA9Q13797 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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ITGA9Q13797 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
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ITGA9Q13797 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
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