Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 LINC00955-202ENST00000514422 1502 ntTSL 4 BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 VPS8-207ENST00000436792 5011 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 SIRPD-202ENST00000381623 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 TTC6-203ENST00000476979 2253 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 KLHL3-209ENST00000508657 6981 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 MATR3-201ENST00000394805 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 ZCCHC11-204ENST00000371544 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 ZNF215-202ENST00000414517 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 DNAJC5G-203ENST00000404433 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AL008638.6-201ENST00000623947 4254 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 PREPL-208ENST00000410081 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 KIAA1524-201ENST00000295746 4075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 CALD1-201ENST00000361675 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 TP63-202ENST00000320472 2032 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 IKZF2-202ENST00000374319 2001 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 MAATS1-201ENST00000273390 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 FBXO38-203ENST00000394370 4132 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 SVIL-202ENST00000375398 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC116050.1-206ENST00000423774 213 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 EIF4A1P5-201ENST00000428062 1095 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC091390.2-201ENST00000432573 374 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AL590609.1-201ENST00000442164 328 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 CLDND1-205ENST00000502288 560 ntTSL 4 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC104123.1-202ENST00000511775 581 ntTSL 4 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AL117190.2-201ENST00000554041 289 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 MIR4450-201ENST00000583589 65 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 YTHDF2P1-201ENST00000604759 1271 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC093458.1-201ENST00000608912 222 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC119619.1-201ENST00000619728 112 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 LINC01176-202ENST00000628121 716 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 MORF4L2-203ENST00000422154 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 BRDT-204ENST00000394530 3207 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 NCKAP1L-202ENST00000545638 3612 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 POLR2D-203ENST00000409955 1758 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC005520.1-201ENST00000556551 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 ZNF236-201ENST00000253159 8124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 S1PR3-202ENST00000375846 8505 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 CALML3-AS1-202ENST00000543008 4531 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 TNS1-201ENST00000171887 10331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 MIGA1-202ENST00000443751 6409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 ERG-204ENST00000398907 4809 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 XRCC6P1-201ENST00000420392 1805 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 RBM46-202ENST00000510397 3626 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 CSMD1-218ENST00000635120 11737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 LY6G6D-223ENST00000375825 402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 RN7SKP136-201ENST00000410927 300 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC068137.1-201ENST00000429272 584 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 WBP1LP7-201ENST00000437905 363 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 SFTPA3P-201ENST00000446429 367 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AL353615.1-201ENST00000450850 390 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 IFNA22P-201ENST00000458710 570 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC027338.2-201ENST00000504382 526 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AP001973.1-201ENST00000530177 572 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
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