Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 FAM47E-202ENST00000502320 6249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 AC005831.1-201ENST00000624384 1697 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 PLEKHG1-201ENST00000358517 7138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms