Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AL359922.2-201ENST00000581788 3017 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 TMEM269-204ENST00000637012 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 YOD1-202ENST00000367084 6291 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 FGFR1OP-202ENST00000366847 14166 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
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