Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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FOXD4Q12950 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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FOXD4Q12950 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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FOXD4Q12950 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
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