Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 CDKL5-202ENST00000379996 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 ZNF620-201ENST00000314529 3291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 PPP2R2A-202ENST00000380737 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 ICK-201ENST00000350082 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 STXBP5L-206ENST00000492541 3114 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 PHACTR1-205ENST00000379350 4784 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 PPP1R14D-201ENST00000299174 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 OR51D1-201ENST00000357605 1124 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AMMECR1-IT1-201ENST00000418848 561 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 PPP1R14D-202ENST00000427255 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AL606490.6-201ENST00000453735 523 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC018475.1-201ENST00000478358 465 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 RN7SL78P-201ENST00000495193 281 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 WARSP1-201ENST00000533936 454 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 PCED1B-AS1-209ENST00000552269 673 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AL139300.2-201ENST00000556332 553 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 PPIAP6-201ENST00000557078 499 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 PDLIM1P2-201ENST00000582923 607 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC006504.5-211ENST00000588636 576 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 PLS3-AS1-201ENST00000606397 521 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 YARS-210ENST00000616261 1167 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AL391987.5-201ENST00000618472 412 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 TYW5-201ENST00000354611 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 CDH23-203ENST00000398788 4329 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 DOCK2-217ENST00000540750 1753 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 ASCC1-202ENST00000317168 2002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 DCAF8L2-202ENST00000451261 2295 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC079331.2-201ENST00000623462 2546 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 HAPLN1-201ENST00000274341 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 RBBP9-201ENST00000337227 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 SSFA2-203ENST00000409136 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 ZC4H2-203ENST00000447788 2649 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 DNAH9-203ENST00000454412 13452 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 VPS45-201ENST00000369128 2224 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 NBAS-201ENST00000281513 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 PIGR-201ENST00000356495 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 SLF2-203ENST00000370271 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 MEIS2-206ENST00000424352 2917 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 MAPK10-202ENST00000359221 2668 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 CCNK-201ENST00000389879 3524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 CACNA1D-203ENST00000422281 6414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 ACTR2-201ENST00000260641 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AOAH-211ENST00000617537 2381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AGMO-201ENST00000342526 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 FAM120B-201ENST00000476287 5155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 SORBS2-209ENST00000418609 5529 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 DDIAS-211ENST00000533655 3533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 TMCC1-201ENST00000393238 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 F5-202ENST00000367797 7024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 ARID4A-201ENST00000348476 5562 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 BACH1-IT2-201ENST00000436529 806 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 LINC01006-205ENST00000440711 336 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC084809.2-201ENST00000444464 512 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 TSSK1A-201ENST00000450724 768 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 RN7SL621P-201ENST00000472565 299 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 RPL12P37-201ENST00000486874 495 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC136628.1-201ENST00000503218 561 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC010457.1-202ENST00000510137 337 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC009927.2-201ENST00000520812 481 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 VPS37A-208ENST00000521005 479 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AL110292.1-202ENST00000552303 568 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 RN7SL726P-201ENST00000605957 299 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AL590491.1-202ENST00000618038 394 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AP000590.1-201ENST00000624943 464 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 LRRC37A11P-201ENST00000425901 3580 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms