Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 CBX5P1-201ENST00000468470 561 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC026826.1-201ENST00000493002 361 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 ZNF138-207ENST00000494380 842 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 MIR6736-201ENST00000616799 59 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC011471.4-201ENST00000638271 216 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 APOL4-212ENST00000616056 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 PNN-201ENST00000216832 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 DDX24-209ENST00000621632 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 CFAP65-201ENST00000295729 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 FNDC3A-206ENST00000541916 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 MPEG1-201ENST00000361050 4442 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC102941.1-201ENST00000567616 1537 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 SERPINB8-208ENST00000542677 3192 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 SHPRH-203ENST00000367505 7201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 HIST1H2BA-201ENST00000274764 516 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AL591503.1-201ENST00000366224 477 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 FAM107B-203ENST00000378462 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 RSPH14-202ENST00000406876 519 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 CD33-203ENST00000421133 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 LINC00266-1-202ENST00000425473 629 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 HSFX3-201ENST00000431993 1264 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 LINC01839-201ENST00000451348 727 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 RN7SL834P-201ENST00000461450 286 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC106800.2-201ENST00000514009 1103 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC011410.1-201ENST00000524175 705 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC107952.1-201ENST00000524200 376 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 RN7SL42P-201ENST00000579786 294 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC005837.2-201ENST00000587459 479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 ZNF675-204ENST00000599168 592 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC122710.3-201ENST00000606566 541 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.1 ms