Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 OR51A10P-201ENST00000307165 937 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 RNU4-81P-201ENST00000363561 144 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 RN7SKP36-201ENST00000363997 312 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 SNORA68-201ENST00000384437 133 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 FGF12-AS3-201ENST00000452848 291 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 RN7SL149P-201ENST00000465197 281 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 AL158068.2-201ENST00000510632 563 ntTSL 4 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 AP006587.5-201ENST00000532033 739 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 AC091932.1-201ENST00000569381 427 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 AC243829.2-201ENST00000617914 470 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 PTP4A1-206ENST00000627002 447 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 SLC13A3-202ENST00000290317 3994 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 DNM1L-207ENST00000452533 4439 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 HTT-201ENST00000355072 13474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 MORF4L2-206ENST00000433176 1965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPREP23469 CEBPZOS-204ENST00000402297 3158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.04
PTPREP23469 YOD1-202ENST00000367084 6291 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPREP23469 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPREP23469 SCAPER-202ENST00000324767 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPREP23469 NT5C2-203ENST00000404739 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPREP23469 DTNA-204ENST00000348997 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPREP23469 TRPM8-201ENST00000324695 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPREP23469 ZFYVE9-204ENST00000371591 4874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPREP23469 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPREP23469 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPREP23469 NR1I3-202ENST00000367980 1403 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPREP23469 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPREP23469 PDXDC1-201ENST00000325823 1113 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPREP23469 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPREP23469 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPREP23469 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPREP23469 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPREP23469 MIR498-201ENST00000385134 124 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPREP23469 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPREP23469 TRAV27-201ENST00000390457 425 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPREP23469 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPREP23469 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPREP23469 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPREP23469 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPREP23469 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPREP23469 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPREP23469 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPREP23469 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPREP23469 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPREP23469 LAPTM4BP1-201ENST00000447781 690 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPREP23469 ZNF331-203ENST00000449416 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPREP23469 AC009244.1-201ENST00000450566 258 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPREP23469 AC005517.1-201ENST00000452091 489 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPREP23469 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPREP23469 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPREP23469 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPREP23469 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPREP23469 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPREP23469 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPREP23469 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPREP23469 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPREP23469 AC122688.2-201ENST00000543922 585 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPREP23469 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
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