Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.4 ms