Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
MIS18AQ9NYP9 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
MIS18AQ9NYP9 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
MIS18AQ9NYP9 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
MIS18AQ9NYP9 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
MIS18AQ9NYP9 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
MIS18AQ9NYP9 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
MIS18AQ9NYP9 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
MIS18AQ9NYP9 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
MIS18AQ9NYP9 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
MIS18AQ9NYP9 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
MIS18AQ9NYP9 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
MIS18AQ9NYP9 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
MIS18AQ9NYP9 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
MIS18AQ9NYP9 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
MIS18AQ9NYP9 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
MIS18AQ9NYP9 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
MIS18AQ9NYP9 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
MIS18AQ9NYP9 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
MIS18AQ9NYP9 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
MIS18AQ9NYP9 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
MIS18AQ9NYP9 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
MIS18AQ9NYP9 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
MIS18AQ9NYP9 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
MIS18AQ9NYP9 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
MIS18AQ9NYP9 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
MIS18AQ9NYP9 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
MIS18AQ9NYP9 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
MIS18AQ9NYP9 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
MIS18AQ9NYP9 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
MIS18AQ9NYP9 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
MIS18AQ9NYP9 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
MIS18AQ9NYP9 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
MIS18AQ9NYP9 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
MIS18AQ9NYP9 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
MIS18AQ9NYP9 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
MIS18AQ9NYP9 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
MIS18AQ9NYP9 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms