Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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