Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 AP1M1-201ENST00000291439 13193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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RNF17Q9BXT8 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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RNF17Q9BXT8 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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RNF17Q9BXT8 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 FAM47E-202ENST00000502320 6249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
RNF17Q9BXT8 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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