Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 RN7SL849P-201ENST00000485236 295 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 RNA5SP518-201ENST00000515957 119 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AC022639.1-204ENST00000520365 569 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AL355102.4-201ENST00000553638 738 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 C14orf2-209ENST00000554880 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 FRG2IP-201ENST00000563581 781 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AC110079.2-202ENST00000629093 698 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AC140479.4-205ENST00000636339 820 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 NFIB-221ENST00000637742 2166 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 DCX-206ENST00000496551 1320 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 OSBPL1A-202ENST00000357041 1869 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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DTX3Q8N9I9 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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DTX3Q8N9I9 NF1P12-201ENST00000549593 583 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 OVCH1-AS1-202ENST00000550906 654 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AC090181.1-201ENST00000560446 264 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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DTX3Q8N9I9 ZNF397-211ENST00000592264 1104 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AC012510.1-201ENST00000607946 759 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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