Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms