Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 NDUFB4P1-201ENST00000462398 381 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 REG4-204ENST00000530654 612 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 INO80-AS1-202ENST00000560178 444 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC068152.1-202ENST00000571901 808 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC097467.3-210ENST00000597939 705 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 ATG12-202ENST00000500945 1430 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 ATP10D-203ENST00000504445 2550 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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VAMP3Q15836 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
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VAMP3Q15836 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
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VAMP3Q15836 RPS3A-201ENST00000274065 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
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VAMP3Q15836 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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VAMP3Q15836 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
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VAMP3Q15836 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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VAMP3Q15836 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 RPL6P24-201ENST00000445338 864 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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VAMP3Q15836 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC209005.1-201ENST00000514043 464 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 CARSP2-201ENST00000520688 277 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 FCGR1CP-201ENST00000579737 1127 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC100832.2-201ENST00000582080 776 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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