Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SS18Q15532 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SS18Q15532 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SS18Q15532 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SS18Q15532 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SS18Q15532 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SS18Q15532 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SS18Q15532 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SS18Q15532 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SS18Q15532 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SS18Q15532 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SS18Q15532 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SS18Q15532 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SS18Q15532 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SS18Q15532 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms