Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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SYCP1Q15431 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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SYCP1Q15431 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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SYCP1Q15431 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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SYCP1Q15431 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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