Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms