Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GTF2H3Q13889 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.7 ms