Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ATP1A4Q13733 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
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