Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 Metazoa_SRP.106-201ENST00000622471 296 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL354702.2-202ENST00000641481 890 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 MKI67P1-201ENST00000604297 1460 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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FOXE3Q13461 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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FOXE3Q13461 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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FOXE3Q13461 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
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FOXE3Q13461 AL162427.1-201ENST00000450399 439 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC091849.1-201ENST00000509920 121 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC010634.1-201ENST00000513925 540 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC011352.2-201ENST00000514574 1016 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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