Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

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Length 987 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
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