Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
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