Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
LMNB1P20700 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
LMNB1P20700 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
LMNB1P20700 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
LMNB1P20700 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
LMNB1P20700 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
LMNB1P20700 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
LMNB1P20700 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMNB1P20700 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
LMNB1P20700 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMNB1P20700 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMNB1P20700 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMNB1P20700 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMNB1P20700 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMNB1P20700 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
LMNB1P20700 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
LMNB1P20700 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMNB1P20700 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
LMNB1P20700 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms