Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms