Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AL355581.1-201ENST00000415964 830 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 MIR5010-201ENST00000582846 120 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms