Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 AC083973.1-201ENST00000523459 590 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 LINC02322-201ENST00000554773 338 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC084782.2-201ENST00000561934 839 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 CYB5B-201ENST00000307892 4286 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 ECI2-204ENST00000380125 1405 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 SLC3A1-206ENST00000409740 1418 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP448-201ENST00000363151 111 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 LELP1-201ENST00000368747 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 RN7SKP254-201ENST00000410685 310 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 LINC00578-201ENST00000439009 542 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC106869.1-202ENST00000441997 604 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AL928654.1-201ENST00000476081 354 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 FBXO16-208ENST00000519471 398 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 ZNF726-203ENST00000525354 806 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC087257.2-201ENST00000538759 928 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC027801.5-201ENST00000574365 416 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC063962.1-201ENST00000608199 521 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC097641.3-201ENST00000613523 464 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC018793.5-201ENST00000640302 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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