Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TM6SF1Q9BZW5 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 263.9 ms