Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TDRD12Q587J7 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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