Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
PTCH1Q13635 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 KCNIP4-202ENST00000382148 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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