Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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CDH18Q13634 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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CDH18Q13634 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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CDH18Q13634 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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CDH18Q13634 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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