Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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