Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NME3Q13232 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NME3Q13232 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NME3Q13232 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NME3Q13232 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NME3Q13232 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NME3Q13232 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NME3Q13232 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NME3Q13232 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NME3Q13232 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NME3Q13232 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NME3Q13232 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NME3Q13232 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NME3Q13232 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NME3Q13232 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NME3Q13232 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NME3Q13232 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NME3Q13232 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NME3Q13232 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NME3Q13232 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NME3Q13232 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NME3Q13232 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NME3Q13232 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NME3Q13232 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NME3Q13232 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NME3Q13232 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NME3Q13232 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NME3Q13232 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NME3Q13232 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NME3Q13232 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NME3Q13232 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NME3Q13232 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NME3Q13232 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms