Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AC007731.3-201ENST00000458154 446 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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FOXC1Q12948 ZNF138-207ENST00000494380 842 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 IGHVIII-13-1-201ENST00000517613 291 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC084033.3-201ENST00000551421 451 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC244034.2-201ENST00000562504 509 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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FOXC1Q12948 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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FOXC1Q12948 AL356056.3-201ENST00000605984 551 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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FOXC1Q12948 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 LINC01002-204ENST00000631644 473 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 TMPRSS4-219ENST00000616579 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AL589642.1-201ENST00000430787 2582 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 TBC1D3P1-DHX40P1-201ENST00000587125 1841 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 MMP25-AS1-206ENST00000573130 4434 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC106882.1-201ENST00000515789 2371 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 BTN2A1-201ENST00000312541 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 DOCK8-204ENST00000432829 7452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 RAI14-220ENST00000512629 2941 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 SRPX2-201ENST00000373004 6679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 CALD1-201ENST00000361675 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 NCKAP1L-201ENST00000293373 9016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 ZNF317-202ENST00000360385 3955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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FOXC1Q12948 DUXAP8-204ENST00000447898 4136 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 RPGR-201ENST00000318842 3108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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FOXC1Q12948 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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FOXC1Q12948 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 LINC02121-201ENST00000507950 432 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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FOXC1Q12948 SNX18P27-201ENST00000523611 779 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 CBX5-204ENST00000550411 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 CUX2P1-201ENST00000606426 298 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC061709.1-202ENST00000615029 527 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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