Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.5 ms