Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RASGEF1BQ0VAM2 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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