Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC244196.4-201ENST00000611787 392 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 MIR6883-201ENST00000614952 78 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 DTNA-221ENST00000591182 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC007012.2-201ENST00000623206 1676 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 ATF3-201ENST00000336937 482 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 SUMO3-202ENST00000397893 520 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RN7SKP188-201ENST00000410789 317 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC016722.1-201ENST00000453936 652 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC097451.1-201ENST00000507388 653 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC008868.1-201ENST00000509786 737 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RNA5SP96-201ENST00000516041 107 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 NQO1-205ENST00000561500 891 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC091932.1-201ENST00000569381 427 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC010761.3-201ENST00000578819 499 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 MIR5010-201ENST00000582846 120 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC245407.2-201ENST00000614199 451 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC106782.7-201ENST00000624024 418 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC133555.5-201ENST00000624430 418 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC140479.4-205ENST00000636339 820 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms