Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC068138.1-201ENST00000412635 217 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 LINC01151-201ENST00000521608 571 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AP001269.1-201ENST00000592820 528 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 ACADSB-202ENST00000368869 1599 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPS29P62273 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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