Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NMBRP28336 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NMBRP28336 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NMBRP28336 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NMBRP28336 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NMBRP28336 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NMBRP28336 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NMBRP28336 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NMBRP28336 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NMBRP28336 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NMBRP28336 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NMBRP28336 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NMBRP28336 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms