Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
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PTPRGP23470 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
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PTPRGP23470 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 SGCD-202ENST00000435422 9755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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PTPRGP23470 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
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PTPRGP23470 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 LINC01047-201ENST00000415193 778 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
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