Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC106800.2-201ENST00000514009 1103 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 SLC6A14-202ENST00000598581 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 NAT1-206ENST00000518029 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms