Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AL355333.1-201ENST00000605632 279 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AC104184.1-201ENST00000607513 721 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AL049541.2-201ENST00000626377 555 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 GRIN2A-205ENST00000535259 4118 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 NBPF14-201ENST00000581201 2931 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 MMP25-AS1-206ENST00000573130 4434 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 NOTCH2-206ENST00000579475 2954 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 ATP5BP1-201ENST00000411980 1574 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 ZNF235-201ENST00000291182 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 SMARCA2-252ENST00000636559 6853 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 BCL2L14-203ENST00000308721 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 MAP4K4-203ENST00000347699 3792 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 HRH1-203ENST00000431010 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AL136985.3-201ENST00000637377 2219 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 KIAA0391-203ENST00000534898 2611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 KLHL32-207ENST00000620278 2642 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 DYNC2LI1-203ENST00000398823 2903 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 DIO2-210ENST00000557010 6367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 OPALIN-204ENST00000419479 3581 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 PPM1L-205ENST00000498165 10934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 SLFN13-209ENST00000533791 4121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 ZC3H11B-202ENST00000636126 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 HEPH-209ENST00000519389 6013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 REG1A-201ENST00000233735 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 PAIP1-202ENST00000338972 1814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 CCDC152-201ENST00000361970 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 HPSE2-204ENST00000404542 3681 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 ARMC3-203ENST00000409049 2479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AC104823.1-201ENST00000413290 989 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AC010148.1-201ENST00000427619 707 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 HSFX3-201ENST00000431993 1264 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 OR51P1P-201ENST00000447547 942 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 PRICKLE2-AS2-201ENST00000484703 496 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 IGLVV-66-201ENST00000523818 341 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 BBOX1-204ENST00000528583 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 UBE2CP1-201ENST00000557130 554 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 CPB2-AS1-202ENST00000606243 2185 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
C9orf172C9J069 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms