Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
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USP35Q9P2H5 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
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USP35Q9P2H5 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
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USP35Q9P2H5 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
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USP35Q9P2H5 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
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USP35Q9P2H5 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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