Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
EHD3Q9NZN3 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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