Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AL590705.5-202ENST00000375204 3161 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 GABRA6-207ENST00000523217 2393 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC015849.5-201ENST00000604907 5473 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 C1orf131-203ENST00000366651 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 HDAC1P1-201ENST00000455482 1445 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP1-201ENST00000365525 307 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 GAGE12E-201ENST00000381698 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 ISY1-202ENST00000393292 988 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 KRT18P52-201ENST00000404956 846 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AL596451.1-201ENST00000419824 572 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AL022100.2-201ENST00000422548 389 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 ELOBP4-201ENST00000423418 296 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 RPSAP62-201ENST00000432596 833 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01747-201ENST00000437696 1067 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC108039.2-201ENST00000440214 359 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AL161454.1-201ENST00000446226 569 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC021088.1-201ENST00000506519 805 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 IGLVIV-59-201ENST00000520218 250 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00964-204ENST00000528090 572 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 CHCHD3P2-201ENST00000550751 639 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC067735.1-201ENST00000551152 526 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC013489.1-201ENST00000561140 598 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC026464.1-202ENST00000564737 722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC010761.6-201ENST00000587898 197 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC005884.1-201ENST00000588604 429 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 MIR7515HG-250ENST00000592565 856 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC073389.2-201ENST00000606726 571 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC012511.1-201ENST00000608140 449 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AL109954.1-201ENST00000619495 557 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC183089.2-201ENST00000637931 916 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 NADK2-201ENST00000282512 2507 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC009318.1-201ENST00000553105 2380 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 CEP97-206ENST00000494050 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 CD86-202ENST00000330540 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC66-203ENST00000394672 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF680-201ENST00000309683 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC093909.4-201ENST00000514297 1991 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 OR7E11P-202ENST00000642027 1491 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 EYA4-213ENST00000531901 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 ZMYM2-202ENST00000382871 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 SGMS1-201ENST00000361543 1096 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.9 ms